Les complications les plus courantes sont d'origines pulmonaires et sont parmis les moins mortelles. Elles sont causées par les bactéries: Streptocoques, Staphylocoques
Des complications plus graves sont d'origines non pulmonaires et sont plus rares. Elles peuvent être cardiaques et mortelles. La plus courante est la fibrillation auriculaire et celle-ci touche généralement les personnes agées.
Des cas isolés de rabdomyolyse2.1 surviennent rarement.
Enfin, les complications peuvent toucher le système nerveux, elles entrainent alors très souvent la mort. Parfois, des cas d'encéphalites apparaissent. En 1918, des cas de folies et de schizophrénies ont été associés à l'épidémie de grippe. Les enfants sont parfois victimes du syndrôme de Reye provoquant un oedème au cerveau qui cause un changement de l'état mental, des nausées et des vomissements, le plus souvent, après avoir contracté une grippe de type B.